古巴的林业管理体制实行“政企分离”，林业政府部门负责宏观管理林业，规范林业发展；国营林业联合企业、农林牧公司负责具体经营林业。

20世纪90年代以来，古巴政府逐步尝试改革，国务委员会通过的林业企业改革原则规定，林业国营企业要自筹资金，自负盈亏，对资金、原料和劳动力有经营管理权，并走向市场。林业职工按劳取酬，工资实行分级制，同时还规定林业企业要从职工工资中扣除5%~7%用于社会保险金。强调林业企业要减少人员编制，但要解决好下岗人员的再就业问题。为此，林业政府部门专门成立了领导小组及由政府官员和专家组成的协作班子以推进林业企业改革，促进林业管理体制健康运行。